熊本地方で7月28日午後、最大震度7を記録した地震の影響で、熊本空港は午後7時に滑走路の運用を再開したが、地震発生後の国内線全便が欠航となった。28日は国内線と国際線合わせて27便が欠航、4便が目的地変更などとなり、計32便に影響が出た。航空各社では、29日は一部便を除き運航を予定している。
熊本空港（資料写真）＝PHOTO: Yusuke KOHASE/Aviation Wire
28日は、国内線の欠航が到着11便、出発10便の計21便。出発便は、午後5時10分に出発予定だった日本航空（JAL/JL、9201）の羽田行きJL634便（ボーイング767-300ER型機、登録記号JA610J）をはじめ、全日本空輸（ANA/NH）、ソラシドエア（SNJ/6J）、ジェットスター・ジャパン（JJP/GK）、フジドリームエアラインズ（FDA/JH）の便に欠航や目的地変更が生じた。到着予定だった便のうち、JALの羽田発JL633便（767-300ER、JA610J）、ANAの那覇発NH1868便（737-800、JA58AN）、羽田発NH645便（エアバスA321neo、JA152A）の計3便は目的地変更となり、JL633便は広島、NH1868便は長崎、NH645便は中部へ向かった。
国際線は到着便のうち、チャイナエアライン（中華航空、CAL/CI）の台北（桃園）発CI194便（A321neo、B-18123）、タイガーエア台湾（TTW/IT）の台南発IT794（A320neo、B-50026）、大韓航空（KAL/KE）のソウル（仁川）発KE2155便（A220-300、HL8091）の計3便欠航となり、スターラックス航空（星宇航空、SJX/JX）の台中発JX316便（A321neo、B-58211）は福岡へ目的地変更した。
28日午後10時現在、ANAとソラシド、ジェットスター・ジャパン、FDAは29日の始発から通常通りの運航を予定。JALは羽田午前6時20分発の熊本行きJL623便など計11便の欠航を決め、1372人に影響が出る見通し。その他の熊本発着便も予約の受付を一時中断している。
気象庁によると、地震は午後4時27分ごろ発生。震源は熊本地方で、震源の深さは10キロ、地震の規模はマグニチュード7.1と推定される。震度7を宇城市と氷川町で観測し、熊本空港がある益城町は震度6強だった。
7/28発生
・熊本で最大震度7、熊本空港は滑走路閉鎖 [3]（26年7月28日）
2016年熊本地震
・熊本空港、出発便も再開 ターミナルは仮復旧 [4]（16年4月19日）
・熊本空港、19日に到着便のみ一部再開 ターミナル閉鎖続く [5]（16年4月18日）
・熊本空港、ターミナル閉鎖 16日は全便欠航 [6]（16年4月16日）
・JALとANA、マイル寄付や復興支援の輸送協力 熊本地震で [7]（16年4月15日）
・JALとANA、16日以降も臨時便 熊本地震で [8]（16年4月15日）
・熊本で震度7 突き上げる揺れ、繁華街でレンガ崩落も [9]（16年4月14日）